| Kods | PA0213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nosaukums | Metabolisma matemātiskā modelēšana | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Statuss | Obligātais/Ierobežotās izvēles | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Līmenis un tips | Pamatstudiju, Akadēmiskais | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tematiskā joma | Bioloģija | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Struktūrvienība | Dabaszinātņu un tehnoloģiju fakultāte | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mācībspēks | Tālis Juhna, Iveta Lauva | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kredītpunkti | 3.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Daļas | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anotācija |
Studiju kursu īsteno Latvijas Universitāte, kursa izstrādātāji ir Egils Stalidzāns un Uldis Kalnenieks. . Studiju kursā tiek apskatīta dažādu modelēšanas pieeju loma metaboliskajā inženierijā. Modelēšana tiek apskatīta vielmaiņas procesu simulēšanas un optimizācijas nolūkos. Semināros tiek analizēti zinātniskie raksti, ar modelēšanas pielietojumiem.. Pilnu studiju kursu skatīt: https://www.lu.lv/studijas/studiju-celvedis/programmu-un-kursu-katalogi/kursu-katalogs/?tx_lustudycatalogue_pi1[action]=detail&tx_lustudycatalogue_pi1[controller]=Course&tx_lustudycatalogue_pi1[course]=Biol2059.. |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Studiju kursa saturs |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Mērķis un uzdevumi, izteikti kompetencēs un prasmēs |
Studiju kursa mērķis ir nodrošināt studentiem iespēju apgūt pamatzināšanas par matemātiskās modelēšanas pielietojumiem vielmaiņas procesu aprakstā un optimizācijā. Studiju kursa uzdevumi: 1) iepazīstināt ar kinētisko modeļu veidošanas principiem un pielietojamību; 2) sniegt zināšanas par stehiometriskās modelēšanas pamatpieņēmumiem, izveidi un pieietojamību; 3) attīstīt prasmes izmantot iteratīvu kinētisko un stehiometrisko modeļu pielietojumu metaboliskās inženierijas uzdevumos; 4) izpētīt modelēšanas rezultātu ieviešanas riski mikroorganismu inženierijā. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Sasniedzamie studiju rezultāti un to vērtēšana |
Izprot stacionāru un dinamisku procesu raksturošanas metodes. Prot raksturot vielmaiņas modeļu izveidi, parametru novērtēšanu un optimizāciju. - Modeļa izveide un parametrizācija ar COPASI. Rakstiks eksāmens. Prot kritiski izvērtēt modeļa adekvātumu pētāmajam bioloģiskajam procesam atkarībā no modelī ieviestajiem ierobežojumiem; adekvāti pielietot kinētisko un stehiometrisko modeļus, atkarībā no uzdevuma nostādnes. Spēj pielietot T vielmaiņas datormodeļu datu bāzes un dažādas manuālās pārbaudes pakāpes. - Modeļa izveide un parametrizācija ar COPASI. Modeļa optimizācija ar COPASI. Rakstisks eksāmens. Spēj pielietot vielmaiņas modeļu izveides pamatprincipus kinētisko un stehiometrisko modeļu gadījumos un izvērtēt reakciju kinētisko vienādojumu piemērotību. - Modeļa optimizācija ar COPASI. Rakstisks eksāmens. |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Studiju rezultātu vērtēšanas kritēriji |
Modeļa izveide un parametrizācija ar COPASI - 30%
Modeļa optimizācija ar COPASI - 30% Rakstiks eksāmens - 40% |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Priekšzināšanas | Mikrobioloģijas pamati. Metabolisms. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Studiju kursa plānojums |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||